Muzeum powstało w styczniu 1946 roku, a więc niespełna półtora roku po rozpoczęciu działalności przez Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej. Pierwszymi jego pracownikami byli preparatorzy Franciszek Ostrowski i Jan Smutek, zaś kustoszem został zoolog i muzeolog z Warszawy Zdzisław Raabe, syn ówczesnego rektora uczelni.